Dolazak Kovača na trenesku poziciju u Bajernu nije doneo i očekivane rezultate. Ekipa iz Minhena igra prilično promenjivo u Bundesligi, gde je trenutno na drugom mestu iza Borusije sa tri boda zaostatka. U Kupu Nemačke situacija nije ništa bolja – Bajern se mučio sa Rodinghausenom, timom koji igra u četvrtoj ligi. Sve ovo utiče i na odnose među Bavarcima.

Kolumbijski fudbaler Rodrigez koji je sigurno najveća zvezda Bajerna otvoreno je više puta kritikovao Kovača, a prema poslednjim vestima u nemačkim medijima, talentovatni fudbaler je čak i dao ulitimatum upravi da odluče hoće li klub napustiti on ili hrvatski trener.